Yayasan Alirena dipercaya oleh Pemerintah Daerah Kabupaten Lanny Jaya untuk mengelola 3 Sekolah Unggulan berasrama di distrik Tiom, Indawa dan Poga mulai tingkat dasar, dan telah merekrut, melatih serta membekali lebih dari 30 guru dalam bidang matematika, sains dan bahasa Indonesia. Guru-guru yang mengajar di Sekolah Unggulan berasal dari pulau Jawa, Sumatera, Kalimantan, Sulawesi dan Nusa Tenggara Timur.

Sekolah Unggulan Tiom dan Indawa dimulai pada Juli 2013, satu tahun kemudian Sekolah Unggulan dibuka di Poga. Program Sekolah Unggulan mengadopsi sistem pembelajaran SAI yang telah terbukti berhasil membantu anak dari berbagai daerah Papuamengejar ketertinggalan mereka. Total jumlah murid sekarang adalah 144.